Hiába állt el a Moto2-es verseny végén rázendítő eső a MotoGP futamának rajtja előtt, így is teljesen vizes pályán rajtolt el a királykategória mezőnye Sepangban. A pole-ból Dani Pedrosa várhatta a piros lámpák kialvását, a start után azonban Johann Zarco vágott az élre. A francia el is lépett a többiektől, míg a második helyre előretörő Jorge Lorenzo is némi előnnyel rendelkezett az egymásra találó világbajnoki esélyesek, Marc Marquez és Andrea Dovizioso előtt.
Kettejük csörtéjéből az olasz került ki győztesen, de spanyol ellenfele még így is vb-címet érő pozícióban motorozott. Közben többeken is kifogtak a körülmények: Loris Baz, Sam Lowes és Alex Rins is elesett (a suzukist második bukása után ki is zárták fekete zászlóval), míg a gyári Yamahák szokás szerint szenvedtek a vizes aszfalton.
Az élen viszont élesedni látszott a helyzet, a Ducatik ugyanis utolérték Zarcót és fél körön belül meg is előzték az újoncot. Lorenzo és Dovizioso sikeresen le is rázta magáról a Tech3 Yamaha motorosát, aki Marquezzel szemben viszont tartani tudta a nagyjából másfél másodperces előnyt. Hat körrel a vége előtt aztán rejtélyes üzenet jelent meg Lorenzo műszerfalán egy motorbeállítással kapcsolatban, amely akár csapatutasítás is lehetett, mindenesetre nem sokkal később elvétette az utolsó kanyart, így Dovizioso átvette tőle a vezetést.
Az olasz pedig onnan már vissza sem nézett, begyűjtötte idei hatodik sikerét, a Ducati pedig kettős győzelemnek örülhetett. Zarco állhatott még dobogóra, míg Marquez biztonsági motorozással negyedik lett – ezzel 21 pontra olvadt az előnye, így még nem lett világbajnok. Mögötte Pedrosa lett az ötödik, majd jött a kivezető körén műszaki problémával félreálló és így a mezőny végéről rajtoló Danilo Petrucci, a top10-et pedig Valentino Rossi, Jack Miller, Maverick Vinales és Pol Espargaro tette teljessé. A szezonzárót két hét múlva rendezik Valenciában.
A futam végeredménye:
1. Andrea DOVIZIOSO ITA Ducati Team Ducati44'51.497
2. Jorge LORENZO SPA Ducati Team Ducati +0.743
3. Johann ZARCO FRA Monster Yamaha Tech 3 Yamaha +9.738
4. Marc MARQUEZ SPA Repsol Honda Team Honda +17.763
5. Dani PEDROSA SPA Repsol Honda Team Honda +29.144
6. Danilo PETRUCCI ITA OCTO Pramac Racing Ducati+30.380
7. Valentino ROSSI ITA Movistar Yamaha MotoGP Yamaha +30.769
8. Jack MILLER AUS EG 0,0 Marc VDS Honda +35.238
9. Maverick VIÑALES SPA Movistar Yamaha MotoGP Yamaha +38.053
10. Pol ESPARGARO SPA Red Bull KTM Factory Racing KTM +39.847
11. Alvaro BAUTISTA SPA Pull&Bear Aspar Team Ducati +42.559
12 .Bradley SMITH GBR Red Bull KTM Factory Racing KTM +44.602
13. Scott REDDING GBR OCTO Pramac RacingDucati +48.696
14. Hector BARBERA SPA Reale Avintia Racing Ducati +50.058
15. Cal CRUTCHLOW GBR LCR Honda Honda +50.705
16. Michael VAN DER MARK NED Monster Yamaha Tech 3 Yamaha +56.397
17. Andrea IANNONE ITA Team SUZUKI EC STAR Suzuki +58.391
18. Tito RABAT SPA EG 0,0 Marc VDS Honda +1'25.571
Nem ért célba:
Sam LOWES GBR Aprilia Racing Team Gresini Aprilia
Karel ABRAHAM CZE Pull&Bear Aspar Team Ducati
Loris BAZ FRA Reale Avintia Racing Ducati
Alex RINS SPA Team SUZUKI ECSTAR Suzuki
